在被选为指挥官的玩家的画面上,会显示战场的全体地图、行动中的玩家以及据点位置等。要一边确认敌我两方的行动来对我方下达像是“某玩家去攻略据点A”的指示。
指挥官还有一个重要的工作,那就是战术支援了。指挥官可以消耗会依时间的经过以及我方击破敌方机体时所累积的战术计量表来进行特殊指令,像是派遣指定范围内进行索敌的“侦察机”,或是让地图上出现美迪亚运输机跟航空机,跟可以设置临时重生点的“补给舰”,以及让白色基地及桑吉巴尔级机动巡洋舰来进行攻击的“战舰”,还有让黑色三连星及凯还有隼人这些原作角色参加战斗的“王牌驾驶”等支援内容。