人物达到12级之后,可以开启副本系统。副本需要通过主城的“副本接引人”NPC进入,而联盟和部落主城不同,所以副本仅限于同阵营的玩家一起组队挑战。副本最重要的收益是天赋星座卡,其他还会产出各类符石、水晶、装备等物品。
游戏的副本难度不低,怪物皮糙肉厚并且攻击力强悍,队伍至少要带一个治疗职业去。由于游戏是回合制网游,并非像WOW一样坦克、输出、治疗铁三角缺一不可,实际上《马尔斯》游戏中也并没有坦克职业。不过即使不算治疗,也仅剩3个输出职业,因此战斗中尽量要协调好,集中火力攻击,尽量减少各自为战的情况。