《火影忍者》的核心玩法基本上围绕着角色的收集而展开,除了日常的副本碎片收集之外,烧钱“十连抽”无疑是最快的收集方式,而游戏中更是有着V7、V10、V14的特权角色购买,不过这些特权购买也只限于一些特殊角色。而游戏中的角色收集程度将影响着玩家的整体战斗力,每个角色都会为队伍提升一定百分比的能力值。
游戏在养成方面相比起同类手游可谓良心不少,玩家们不必再挨个的强化角色,而是采用统一的强化升级。装备、天赋、勾玉、密卷、召唤兽以及神器这些构成了游戏中所有的养成方式。以上强化将会影响到队伍的整体战斗力,不过也免去了玩家们逐个培养角色的麻烦。